A la par de esta gran labor evangelizadora ha estado desde siempre la Santa Sede, en la persona de los Papas sucesores del Bienaventurado Pedro, fundamento visible en el que Cristo mismo ha querido fundar su Iglesia (cf. Mt 16,17-18).
La Santa Sede acompañó desde sus orígenes el camino de las Iglesias de Centroamérica, enviando misioneros y enviando sus representantes. A través de éstos se fueron creando los Concordatos con Centroamérica. A través de estos Documentos la Santa Sede ratificaba junto al Estado particular, regular las relaciones entre éste y la Iglesia local radicada en su territorio. Además desde el punto de vista eclesiástico, un concordato pretende garantizar las libertades de la Iglesia y legislar sobre las materias mixtas, aquellas en las cuales la Iglesia y el Estado poseen intereses que pueden ser causa de disputa. Estos concordatos o tratados surgieron en América luego de las independencias, ya que era necesario ordenar las relaciones entre los Estados y la Santa Sede.
Más tarde superados muchos de los baches dejados por la independencia, se realizaron los primeros nombramientos de Nuncios Apostólicos para la región, y en referencia directa con Honduras, está en primer lugar el nombramiento de Monseñor Giovanni Cagliero (1838-1926). Mons. Cagliero fue el Delegado Apostólico de la Santa Sede en la región centroamericana entre los años 1908 y 1915. Con residencia en Costa Rica, visitó los demás países centroamericanos enviando amplios informes sobre la situación de las Iglesias particulares de cada país. Fruto de su labor es la creación de las Provincias Eclesiásticas de El Salvador y de Nicaragua, ambas en 1913 y de Honduras en 1916. En este período se nombró al primer Arzobispo Metropolitano de Tegucigalpa, Monseñor José María Martínez y Cabañas por el Su Santidad Benedicto XV.
Le sigue Monseñor Giovanni Battista Marenco (1853-1921): Mons. Marenco con residencia también en Costa Rica, fue el representante de la Santa Sede para Centroamérica desde 1917, como Internuncio Apostólico para Costa Rica, Honduras y Nicaragua (1917-1921) y Delegado Apostólico para Guatemala y El Salvador (1920-1921).
Monseñor Angelo Rotta (1872-1965): Nuncio entre 1922-1925, especialmente durante el período de dos años 1923-24, cuando denunció repetidamente la condición del Clero de las Repúblicas Centroamericanas, aludiendo a las razones históricas, geográficas y climáticas de tal situación. Informó además sobre la general inestabilidad política de los gobiernos de la época, el crecimiento de la secularización, la escases de escuelas y la frágil formación cristiana en las familias. Advertía ya en su momento la lenta pero progresiva práctica de matrimonios de hecho y la aprobación del divorcio civil. Todo lo anterior hizo que Monseñor Rotta diera un decisivo apoyo a las obras parroquiales, la pastoral de la juventud y su solidaridad con los pobres. Bajo este servicio diplomático y bajo el mandato del Papa Pio XI, se eligió y realizó la ordenación episcopal el 3 de febrero 1923 del segundo Arzobispo Metropolitano de Tegucigalpa a Monseñor Agustín Hombach.
Monseñor Giussepe Fietta (1883-1960): De él tenemos una más nutrida información, fue Nuncio entre 1922-1925. Ordenado sacerdote el 4 de noviembre de
1906. Luego se desempeñó como secretario privado del obispo de Alghero, Oristano y Cagliari hasta 1923. Monseñor Fietta fue elevado al rango de Prelado Doméstico de Su Santidad el 9 de mayo de 1920 y se desempeñó como Rector del Seminario de Alghero y canónigo de su Catedral de 1923 a 1924, de donde partió para ser secretario de la Nunciatura en Costa Rica. Más tarde fue nombrado Encargado de Negocios a. i. de la Nunciatura costarricense en 1925. Será en este mismo año que el Santo Padre Pio XI declaró a Santa María de Suyapa, Patrona de Honduras, marcando su fiesta en el calendario para el 3 de febrero.
Monseñor Carlo Chiarlo (1881-1964): Sirvió entre 1926 y 1930 como Nuncio en países de Centroamérica.
Monseñor Alberto Levame (1881-1951): Su servicio diplomático lo ejerció entre 1933-1937. Su primer cargo fue Nuncio concurrente para las Nunciaturas de El Salvador y Honduras, luego siguió períodos en Uruguay y Egipto. Como internuncio en El Cairo participó en las negociaciones que trajo un acuerdo a la controversia de larga data sobre la enseñanza de la religión cristiana en las escuelas.
Monseñor Federico Lunardi (1880-1954): Ejerció su servicio diplomático entre 1938-1947. A principios de 1939, fue trasladado de Bolivia a Honduras, donde permaneció hasta 1948, casi una década. Su presencia en Honduras le hace pasar a los anales de la historia por sus viajes a lo largo y ancho del país. Frecuentando sobre todo la zona arqueológica de Copán Ruinas, sede de la civilización Maya, que estaba en el esplendor de la investigación y re-descubrimiento. Sus publicaciones sobre Honduras son numerosas y algunas de gran importancia, como Honduras Maya. Realidad Etnóloga Y Arqueóloga de Honduras, impresas en 1948 en Tegucigalpa. Desde Honduras en 1948 fue llamado a Roma a la Secretaría de Estado, pero ya al año siguiente fue destinado a Asunción, Paraguay (1949-1954). Al final de su período el Papa Pio XII nombró al tercer Arzobispo Metropolitano de Tegucigalpa a Monseñor José de la Cruz Turcios y Barahona, en 1947. Con Monseñor Lunardi se iniciaron los trabajos de la actual Nunciatura Apostólica.
Liberato Tosti (1883-1950): Fue Nuncio de Honduras y Nicaragua entre 1948 y 1949.
Antonio Taffi (1897-1970): Su ordenación episcopal se realizó en 1946 y entre los años 1950 y 1959 fue Nuncio Apostólico concurrente para Nicaragua y Honduras. En su servicio apostólico se nombró como Obispo Auxiliar de Tegucigalpa a Monseñor Evelio Domínguez Recinos el 27 de diciembre de 1957. Durante este período el Papa Juan XXIII, nombrò a Monseñor Héctor Enrique Santos y Hernández como Obispo de Santa Rosa de Copán, ordenado el 12 de diciembre de 1958. Con Mons. Taffi se inauguró la actual Nunciatura Apostólica en 1951.
Sante Portalupi: Nuncio de Su Santidad en Honduras entre 1959 y 1968. En 1962 bajo su servicio apostólico hace el traslado de Monseñor Héctor Enrique Santos, Obispo de Santa Rosa de Copán a la sede de la Arquidiócesis de Tegucigalpa como cuarto Arzobispo.
Lorenzo Antonetti: Licenciado en Teología, Laureado en Derecho Canónico. Nació en Romagnano Sesia, Novara, Italia, el 31 de julio de 1922. Ordenado sacerdote en Novara, Italia, el 25 de mayo de 1945. Consagrado Arzobispo en Roma el 12 de mayo de 1968 para el servicio diplomático de la Santa Sede. Llegó a Honduras el 5 de julio de 1968. Fue el Nuncio Apostólico que acompañó el proceso de renovación de la Iglesia Católica en Honduras tras el Concilio Vaticano II. También fomentó la cooperación entre la Iglesia y el Estado.
Gabriel Montalvo Higuera (1930-2006): Ordenado sacerdote en Roma, el 18 de enero de 1953, pocos días antes de cumplir los 23 años. Consagrado Arzobispo también en Roma el 30 de junio de 1974, por su Santidad Pablo VI. Fue Nuncio de Su Santidad en varios países del mundo. El 14 de junio de 1974 fue nombrado Nuncio Apostólico para Honduras y Nicaragua por el Papa Pablo VI, permaneciendo en el cargo hasta el 18 de marzo de 1980, que pasa a ser Nuncio en Argelia, Túnez y Delegado Apostólico en Libia.
Ha sido Monseñor Montalvo el que presidió la Ordenación Episcopal del primer Cardenal hondureño, Óscar Andrés Rodríguez Maradiaga, SDB, el 8 de diciembre de 1978, en su momento como Obispo Auxiliar de Tegucigalpa. También impulsó la creación de la Conferencia Episcopal de Honduras y la organización de la Iglesia en todo el país.
Andrea Cordero Lanza di Montezemolo (1925-2017): Fue nombrado subsecretario y luego secretario de la Comisión Pontificia Iustitia et Pax. El 5 de abril de 1977 fue nombrado Arzobispo titular de Anglona y Pro-Nuncio Apostólico en Papúa Nueva Guinea y Delegado Apostólico en las Islas Salomón, recibiendo la ordenación episcopal el 4 de junio de 1977. El 25 de octubre de 1980 fue trasladado a las Nunciaturas Apostólicas en Honduras y Nicaragua, y el 1 de abril de 1986 fue nombrado Nuncio Apostólico en Uruguay. Luego el 28 de abril de 1990 fue nombrado Delegado Apostólico en Jerusalén y Palestina. El 28 de mayo del mismo año fue nombrado Nuncio Apostólico en Chipre y Delegado Apostólico en Jordania. Posteriormente fue el Rector de la Patriarcal Basílica de San Pablo fuera de los muros en Roma. En el año de 1983 el Santo Padre Juan Pablo II, visitó Honduras.
Francesco De Nittis (1933-2014): En 1981 nombrado Arzobispo titular de Tunes y luego Nuncio Apostólico en Papúa Nueva Guinea y Delegado apostólico en las Islas Salomón. De Nittis fue nombrado Nuncio Apostólico de El Salvador y Honduras el 19 de abril de 1986 hasta el 25 de junio de 1990, cuando fue promovido como Nuncio Apostólico en Uruguay.
Manuel Monteiro de Castro (1938-actualidad): En agosto de 1990 fue nombrado Nuncio Apostólico para El Salvador y Honduras, donde se mantuvo hasta 1997. Fue una época muy complicada ya que estuvo en el momento de plena ofensiva de la guerrilla salvadoreña. Luego de 1998 al año 2000 fue Nuncio Apostólico en Sudáfrica, Namibia, Lesotho, Swazilandia y Delegado Apostólico en Botswana. Este último año el Papa Juan Pablo II le nombró Nuncio de España y el Principado de Andorra donde estuvo hasta 2009.
Luigi Conti (1929-2015): El 19 de noviembre de 1983, fue nombrado Nuncio Apostólico para Irak y Kuwait. El 17 de enero de 1987 para Ecuador. El 12 de abril de 1991 Nuncio Apostólico en Honduras. Luego el 15 de mayo de 1999 transferido para Turquía y Turkmenistán. Mientras ocupaba este cargo, el Papa Juan Pablo II le hizo representante Papal de referencia en el genocidio armenio. Dos años después, fue nombrado Nuncio Apostólico en Malta y Libia. En su servicio Apostólico fue nombrado Obispo para la diócesis de San Pedro Sula, Monseñor Ángel Garachana Pérez, ordenado el 3 de febrero de 1995. Con él también llega al Arzobispado de Tegucigalpa el 3 de febrero de 1992, Monseñor Oscar Andrés Rodríguez Maradiaga, que fungía hasta la fecha como Obispo Auxiliar.
George Panikulam (1942-actualidad): Llegó a Honduras el 4 de diciembre de 2003. El 3 de julio de 2008 fue nombrado Nuncio Apostólico en Mozambique. En su servicio Apostólico en el País, nombró a Monseñor Roberto Camilleri (1951-2023), como Obispo Auxiliar de la Arquidiócesis de Tegucigalpa y luego Obispo de Comayagua. A Monseñor Luis Solé como Obispo de la diócesis de Trujillo, consagrado Obispo el 29 de junio de 2005.
Antonio Arcari (1953- actualidad): Nuncio en Honduras del 18 de julio del 2003 al 12 de diciembre de 2008 . En su servicio apostólico fueron nombrados los Señores Obispos Auxiliares de Tegucigalpa: Monseñor Juan José Pineda Fasquelle el 16 de julio de 2005 y Monseñor Darwin Andino el 1 de abril del 2006. Se creó la diócesis de Yoro y nombró a su primer Obispo, Monseñor Jean-Louis Giasson el 19 de septiembre de 2005.
Luigi Bianco (1960-actualidad): Nombrado Nuncio Apostólico para Honduras el 12 de enero de 2009 hasta el 12 de julio del 2014. Realizó el nombramiento de Monseñor Héctor David García Osorio, como Obispo Titular de la Diócesis de Yoro, tras la renuncia de Monseñor Giasson, el 3 de julio del 2014. A Monseñor Michael Lenihan, como primer Obispo de la creada diócesis de La Ceiba, ordenado el 11 de febrero de 2012. Nombrado por igual en su período a Monseñor Joseph Bonello, como Obispo Coadjutor el 12 de febrero de 2011 y luego Obispo titular de la Diócesis de Juticalpa en 2012. Obispo también para la diócesis de Choluteca a Monseñor Guy Charbonneau ordenado el 20 de abril de 2013, tras la renuncia de Monseñor Guy Plante.
Novatus Rugambwa (1957-actualidad): Nació en 1957 en Bukoka (Tanzania), entró al servicio diplomático vaticano en 1991. Desempeño su tarea pastoral en Panamá, Congo, Brazzaville, Paquistán, Nueva Zelanda e Indonesia. Nuncio Apostólico en Honduras desde el 2015 al 2019. En su servicio apostólico se creó al Diócesis de Danlí, habiendo sido nombrado Monseñor José Antonio Canales Motiño y ordenado el 11 de marzo de 2017.
Gábor Pintér (1964-actualidad): Honrado como capellán de Su Santidad por el Papa Juan Pablo II el 2 de septiembre de 1997. El 30 de marzo de 2007 fue elevado al cargo de Prelado de Honor de Su Santidad por el Papa Benedicto XVI. El 13 de mayo de 2016, el Papa Francisco lo nombró Nuncio Apostólico en Bielorrusia. Fue consagrado obispo el 15 de julio de ese año por el Cardenal Secretario de Estado, Su Eminencia Pietro Cardenal Parolin, asistido por el Cardenal Arzobispo de Esztergom-Budapest, Péter Erdő, y Monseñor Miklós Beer de Vác.
Nuncio Apostólico para Honduras desde el 12 de noviembre de 2019 hasta la fecha. Ha creado en su servicio apostólico la Arquidiócesis de San Pedro Sula con su primer Arzobispo Monseñor Michael Lenihan y la Diócesis de Gracias con su primer Obispo Monseñor Walter Guillén Soto, ordenado el 11 de junio de 2021. Se nombró
Obispo Auxiliar de Tegucigalpa a Monseñor Teodoro Gómez, ordenado el 15 de mayo de 2021 y actualmente Obispo de la Diócesis de Choluteca. Al Arzobispo de Tegucigalpa a Monseñor José Vicente Nacher Tatay, ordenado el 25 de marzo de 2023. Al Obispo de Trujillo a Monseñor Henry Orlando Ruíz Mora, ordenado el 6 de mayo de 2023. Ante la muerte inesperada de Monseñor Roberto Camilleri de la diócesis de Comayagua, se ha nombrado Obispo a Monseñor Ángel Falsón. En el mes de junio de 2024 se prepara también el nombramiento del nuevo Obispo de La Ceiba.
